Análisis de BRAF
Se realizó la amplificación del ADN genómico de
la región correspondiente al exón 15 del gen BRAF
(NCBI Ref. Seq. NG_007873.1), mediante
reacción en cadena de la polimerasa (PCR), con el
par de cebadores (primers).Para comprobar la
integridad de la muestra se realizó la detección en
simultaneo del gen constitutivo K-RAS. La
amplificación por PCR se hizo en un volumen final
de 25 μl, utilizando 2,5 μl de ADN, 200 μM de
cada dNTPs, 0,5 U de GoTaq DNA Polymerasa
(Promega), 5 μl buffer GoTaq 5x conteniendo 1,5
mM de MgCl2 (Promega), 0,5 μl de MgCl2 y 0,16
μM de los cebadores forward y reverse. Las
condiciones de amplificación fueron: un ciclo
inicial de desnaturalización a 94 ºC durante 5
minutos, seguido de 35 ciclos de;
desnaturalización a 94 ºC durante 45 segundos,
alineamiento (annealing) a 58 ºC durante 45
segundos y extensión de 45 segundos a 72 ºC con
una extensión final de 5 minutos a 72 ºC. Se
verificó el producto de PCR esperado mediante
electroforesis en gel de agarosa al 1,8% y
visualización en transiluminador UV, aislando la
banda de interés de 224 pb. Para la purificación del
fragmento de ADN, se empleó el sistema
Extraction Kit Wizard Sv Gel and PCR Clean Up
System (Promega). Se realizó la reacción de
secuencia del eluido con Big Dye Terminator v1.1
(Applied Biosystems), en ambas direcciones por
separado y con los mismos cebadores empleados
en la reacción de PCR. El producto se purificó en
columnas de Sephadex (Centri Sep Spin Columns
–Princenton Separations-), y la secuenciación se
llevó a cabo en un analizador ABI Prism310
Genetic Analyser (Applied Biosystems). Por
último, se analizó el electroferograma del
fragmento secuenciado comparándolo contra la
secuencia de referencia para detectar la mutación
puntual en el codón V600.
Resultados
Los individuos que concurrieron a consejo
genético derivados del servicio de Oncología de la
Clínica Universitaria Reina Fabiola poseían una
alta probabilidad de ser portadores de una
mutación, es decir, eran individuos que tenían una
agregación familiar de cáncer significativa o un
diagnóstico de cáncer a una edad más precoz de la
habitual.
Los resultados de los estudios de pacientes con
cáncer de mama/ovario que concurrieron al
consejo genético y que en virtud de sus
antecedentes se les solicitó test genético, muestran
que el tipo de tumor predominante fue el triple
negativo 22/34 (64,7 %) (se caracteriza por la
ausencia de expresión de los receptores de
estrógeno, de progesterona y del receptor 2 del
factor de crecimiento epidérmico humano HER2),
en cambio el Luminal A presentó 6/34 (17,64 %),
el Luminal B 1/34 (2,94 %) y cinco pacientes
presentaron cáncer de ovario 5/34 (14,70 %). El
paciente
7
, 1/34 (2,94 %) presentó la mutación del
BRCA 2 (Tabla 1). En este, se ha detectado en el
exón 11 del gen BRCA2 la deleción en
heterocigosis, del nucleótido T en la posición
genómica chr13:32914438, variante c.5946delT-
p.Ser1982Argfs*22 generando el corrimiento del
marco de lectura (frameshift), la cual se confirmó
mediante la secuenciación Sanger convencional.
Este corrimiento produce en el posición
nucleotídica 2003 un codón de parada prematuro
(codón stop) dando lugar a un transcripto (mRNA)
truncado, por el alelo con la variante frameshift.
Esta variante descripta en Human Gene Mutation
Database (HGMD), número de acceso ID
CD961857, como asociada a un incremento en la
susceptibilidad del riesgo de Cáncer de Mama y
Ovario Hereditario. En el grupo de pacientes
evaluados en el consejo genético y a los cuales se
les solicitó test genético por sus antecedentes por
cáncer de colon se detectó IMS-alta en 4 de los 31
casos (12,9 %), uno menor de 50 años y tres
mayores de 50 años. Además, 11/31 (35,5 % ),
fueron inestables para D17S250, 3/31 (9,7 %)
fueron inestables para D5S346, 2/31,(6,4 %)
fueron inestables para D2S123 y BAT 25, BAT 26
presentaron inestabilidad en 1/31 (3,2 %) (Tabla
2). No se detectaron rearreglos genómicos (pérdida
ni ganancia de material genético) en los genes
MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 y regiones 3´de
EPCAM por MLPA en los pacientes que
presentaron IMS-alta (Tabla 3). El análisis de la
mutación V600E del gen BRAF fue positivo en los
cuatro pacientes con IMS-alta (Tabla 4). Los
cuatro pacientes con cáncer de colon con
resultados de los test genéticos positivos para CCR
tenían antecedentes familiares de cáncer de colon.
Los resultados de los estudios genéticos se
informaron en forma personal a los efectos de
responder a las preguntas y dudas que pudieran
surgir y valorar el posible impacto psicológico. Se
les explicó los resultados y se aseguró la
comprensión de los mismos. También se
establecieron planes para compartir los resultados
con familiares, se le aclararon dudas se preservó la
confidencialidad de los resultados y en algunos
casos se ofreció apoyo psicológico. El control de
las personas de alto riesgo se realizó en la unidad
de consejo genético a los efectos del seguimiento
de la misma y la familia a largo plazo, con
actualización de la historia familiar y valoración de
las modificaciones, revisación del control médico